Kode Etik SPI IAIN Madura adalah sebagai berikut:

1. Menunjukkan kejujuran, objektivitas, dan kesungguhan dalam melaksanakan tugas dan memenuhi tanggung jawab profesinya dengan menghindari adanya conflict of interest.
2. Menunjukkan loyalitas terhadap organisasinya atau terhadap pihak yang dilayani.
3. Menghindari tindakan atau kegiatan secara sadar yang dapat mendiskreditkan profesi audit internal/verifikator atau mendiskreditkan IAIN Madura.
4. Menahan diri dari kegiatan-kegiatan yang dapat menimbulkan konflik dengan kepentingan, kegiatan-kegiatan yang dapat menimbulkan prasangka, yang meragukan kemampuannya untuk dapat melaksanakan tugas dan memenuhi tanggung jawab profesinya secara objektif.
5. Menolak imbalan dalam bentuk apapun dari karyawan, client, pelanggan, pemasok, atau mitra iain madura, sehingga dapat mempengaruhi pertimbangan profesionalnya.
6. Bersikap hati-hati dan bijaksana dalam menggunakan informasi yang diperoleh dalam pelaksanaan tugasnya. Auditor internal/verifikator tidak boleh menggunakan informasi rahasia:

1. Untuk mendapatkan keuntungan pribadi;
2. Secara melanggar hukum; atau
3. Yang dapat menimbulkan kerugian terhadap iain madura.

7. Mengungkapkan semua fakta fakta penting yang diketahuinya dalam melaporkan hasil pekerjaan, yaitu fakta-fakta yang jika tidak diungkap dapat:

1. Mendistorsi kinerja kegiatan yang di review; atau
2. Menutupi adanya praktek-praktek yang melanggar hukum.

8. Meningkatkan keahlian dan efektivitas serta kualitas pelaksanaan tugasnya.